La Administración y Gobierno de la asociación corresponde a los siguientes órganos:
La Asamblea General de todos los socios, debidamente convocada y constituida, representa la máxima autoridad en orden al gobierno y dirección de la asociación, gozando de la plenitud de poderes para la realización del objeto y cometidos de la misma, y sus decisiones vincularán a todos los asociados, incluso a los disidentes o ausentes sin perjuicio del derecho de impugnación que pudiera corresponderles.
La Junta Directiva es el órgano ejecutivo de esta asociación y ejercerá la representación, dirección y administración de la misma, correspondiendo a ella hacer cumplir los acuerdos aprobados por la Asamblea General. En la actualidad, la Junta Directiva de ALCER Giralda está compuesta por:
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Presidente: Pablo Beca
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Vicepresidente y Tesorero: Mario Sánchez.
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Secretario: Eloy López.
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Vicesecretario: Antonio Fuentes
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Vocales (por oden de nombramiento): Isabel Mª Martín, Julia Mahíndo, Teresa Seda, Mercedes Eslava, Francisco Franco y Manuel Quesada.
El vocal de la Junta Directiva Manuel Quesada actúa como Delegado de la asociación en la provincia de Huelva.
En aquellas decisiones en las que por su naturaleza se requiera un asesoramiento técnico, la Junta Directiva estará asistida por las Comisiones y Asesorías Técnicas, que para tal fin se crean, las cuales presentarán el informe correspondiente.